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在微生物家族中,真菌是最为庞杂的一支 。它们种类多、数量大 、繁殖快、分布广,与人类的关系极为密切。小型的真菌 ,只有在显微镜下才能一睹它们的芳容;较大型的真菌,如灵芝、香菇 、木耳之类,已经大到人人可见。不过即使是真菌家族中最小的成员——酵母菌和霉菌 ,它们与细菌、放线菌相比,也要大几倍至几十倍 。所以真菌的基因组可大可小,范围是相当大的。
目前已经测序完毕的酵母中编码RNA或蛋白质的大约2600个基因。通过对酿酒酵母的完整基因组测序 ,发现在12068kb的全基因组序列中有5885个编码专一性蛋白质的开放阅读框 。这意味着在酵母基因组中平均每隔2kb就存在一个编码蛋白质的基因,即整个基因组有72%的核苷酸顺序由开放阅读框组成。这说明酵母基因比其它高等真核生物基因排列紧密。如在线虫基因组中,平均每隔6kb存在一个编码蛋白质的基因;在人类基因组中 ,平均每隔30kb或更多的碱基才能发现一个编码蛋白质的基因 。酵母基因组的紧密性是因为基因间隔区较短与基因中内含子稀少。酵母基因组的开放阅读框平均长度为1450bp即483个密码子,最长的是位于XII号染色体上的一个功能未知的开放阅读框(4910个密码子),还有极少数的开放阅读框长度超过1500个密码子。在酵母基因组中,也有编码短蛋白的基因 ,例如,编码由40个氨基酸组成的细胞质膜蛋白脂质的PMP1基因 。此外,酵母基因组中还包含:约140个编码RNA的基因 ,排列在XII号染色体的长末端;40个编码SnRNA的基因,散布于16条染色体;属于43个家族的275个tRNA基因也广泛分布于基因组中。
文库可被定义为所有可能组合的集合或者关于集合的研究。文库最初的含义是储存文献和艺术资料以供阅读, 参考, 借阅等活动的地方,现在多用其引申含义。 分子生物学中所指的文库 ,一般是说基因组文库 。是某种特定的生物所含有的、能够涵盖所有该物种基因的 、足够数目的DNA片断克隆的集合。 基因组文库的构建,大体是通过:①纯化细胞总DNA;②利用限制性酶酶切使之产生大小合适的片段;③将这些片断插入载体大量克隆;④搜集阳性克隆来完成的。 此外还有cDNA文库和蛋白质文库 。 基因组文库的用途待补充。 文库的最初含义今天也很常用,比如:百度文库。 从文学角度来看文库就是多册成套出版的图书 。它与丛书的性质相同 ,但往往较丛书规模更大,读者对象更为明确,一般是按照编辑计划 ,选择各种已印行的读物或专门为之编写的著作,分门别类配套而成。具有内容取材广泛、注重基础知识和风格独特的特点。如1949年前上海商务印书馆编辑出版的《万有文库》,1949年后中国青年出版社编辑出版的《青年文库》等 。
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